More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1891 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  89.13 
 
 		 467 aa  748    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  82.08 
 
 		 469 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  89.55 
 
 		 469 aa  748    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  89.77 
 
 		 467 aa  782    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 469 aa  904    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  80.52 
 
 		 466 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  82.77 
 
 		 469 aa  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  91.9 
 
 		 471 aa  766    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  67.26 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  66.89 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  63.1 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  65.62 
 
 		 461 aa  531  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  66.89 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  65.38 
 
 		 460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.44 
 
 		 473 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  58.3 
 
 		 483 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.67 
 
 		 473 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  65.85 
 
 		 465 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  63.62 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  61.89 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  61.89 
 
 		 454 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  58.3 
 
 		 441 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  57.53 
 
 		 443 aa  458  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.56 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  53.19 
 
 		 443 aa  418  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  53.99 
 
 		 452 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.6 
 
 		 465 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  56.18 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  50.11 
 
 		 456 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  49.25 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.25 
 
 		 470 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  51.12 
 
 		 453 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  51.52 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  50.55 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  53.23 
 
 		 450 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  48.91 
 
 		 454 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  50.56 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  49 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  52.48 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  54.18 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  49.67 
 
 		 450 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  51.56 
 
 		 453 aa  362  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  48.25 
 
 		 456 aa  359  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  51.84 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  49.22 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  45.05 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.66 
 
 		 457 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  48.01 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  53.45 
 
 		 445 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.22 
 
 		 450 aa  336  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  47.73 
 
 		 417 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  47.71 
 
 		 452 aa  329  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.77 
 
 		 447 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  46.87 
 
 		 454 aa  314  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  46.17 
 
 		 418 aa  312  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  46.74 
 
 		 431 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  45.91 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  45.63 
 
 		 451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.96 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  45.35 
 
 		 507 aa  277  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  34.03 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  29.08 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.75 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  32.72 
 
 		 388 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  26.88 
 
 		 393 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.98 
 
 		 382 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  30.42 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30.42 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30.42 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.35 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.74 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  27.35 
 
 		 394 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.33 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.17 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.89 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.07 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  27.44 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.27 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.27 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.68 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  29.21 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  27.87 
 
 		 399 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  25.41 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.41 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  28.13 
 
 		 401 aa  124  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  25.45 
 
 		 392 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  25.27 
 
 		 398 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.08 
 
 		 400 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  25.47 
 
 		 376 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  26.79 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.91 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  27.45 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  28.87 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  25.54 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  27.01 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  27.01 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  25.47 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  37.8 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  28.07 
 
 		 390 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>