More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0842 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 		 395 aa  776    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.84 
 
 		 392 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  63.95 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  61.22 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  60.36 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  60.36 
 
 		 392 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  60.51 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  60.26 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  60.26 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  60.26 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  60.1 
 
 		 385 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.11 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  61.46 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  61.84 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  57.77 
 
 		 390 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  61.58 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  61.58 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  60.85 
 
 		 390 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  57.73 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  59.5 
 
 		 401 aa  415  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  59.47 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  59.95 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  58.91 
 
 		 382 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.16 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  56.92 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  59.69 
 
 		 188 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  59.69 
 
 		 188 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  67.5 
 
 		 187 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  67.5 
 
 		 187 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  36.1 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.46 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.2 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  32.89 
 
 		 382 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  29.67 
 
 		 389 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.43 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.55 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  30.05 
 
 		 376 aa  176  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  30.93 
 
 		 376 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  33.33 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.66 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.79 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.55 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.29 
 
 		 388 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  29.75 
 
 		 443 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  33.14 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.38 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  29.17 
 
 		 444 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  29.52 
 
 		 456 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  27.39 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.86 
 
 		 456 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.11 
 
 		 391 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  30.18 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  28.45 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  28.88 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  30.39 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  27.55 
 
 		 454 aa  149  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  29.35 
 
 		 456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.68 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  30.37 
 
 		 450 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.56 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  30.65 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  25.22 
 
 		 483 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  29.41 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.31 
 
 		 450 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  29.83 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  27.65 
 
 		 456 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  29.57 
 
 		 378 aa  140  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  29.24 
 
 		 408 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  28.46 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  26.9 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.79 
 
 		 395 aa  132  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.95 
 
 		 469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  27.42 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.73 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  26.87 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  28.53 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  24.8 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  30.2 
 
 		 430 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  29.62 
 
 		 358 aa  126  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.23 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  28.71 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.86 
 
 		 352 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  29.41 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  27.25 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  28.32 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  28.42 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.16 
 
 		 348 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  27.37 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  29.38 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  27.3 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.12 
 
 		 386 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  29.23 
 
 		 425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.2 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  30.53 
 
 		 390 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  31.79 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  31.09 
 
 		 407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  28.68 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  29.23 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  29.1 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>