More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1753 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  88.49 
 
 
469 aa  762    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  79.57 
 
 
466 aa  687    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  89.77 
 
 
469 aa  760    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
467 aa  904    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  98.29 
 
 
467 aa  885    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  95.52 
 
 
471 aa  786    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  81.78 
 
 
469 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  82.55 
 
 
469 aa  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  66.09 
 
 
462 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  66.89 
 
 
463 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  63.24 
 
 
469 aa  542  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  66 
 
 
461 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  65.92 
 
 
471 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.91 
 
 
473 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  66 
 
 
460 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.29 
 
 
473 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  55.91 
 
 
483 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  66.52 
 
 
465 aa  497  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  62.95 
 
 
466 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  59.69 
 
 
454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  59.69 
 
 
454 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.97 
 
 
441 aa  455  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  56.42 
 
 
443 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.91 
 
 
467 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  52.12 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  49.89 
 
 
456 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.27 
 
 
465 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.69 
 
 
468 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  50.32 
 
 
456 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  51.93 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  50.43 
 
 
453 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.36 
 
 
470 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  51.37 
 
 
463 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  53.72 
 
 
450 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  49.67 
 
 
450 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  50 
 
 
444 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  48.06 
 
 
454 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  54.34 
 
 
447 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  51.21 
 
 
455 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  52.56 
 
 
449 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  50.55 
 
 
450 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  49.78 
 
 
453 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  45.01 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  51.14 
 
 
432 aa  349  6e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  46.64 
 
 
456 aa  346  6e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  48.02 
 
 
456 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.36 
 
 
450 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.67 
 
 
457 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  47.56 
 
 
446 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  49.34 
 
 
445 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  48.26 
 
 
452 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  46.17 
 
 
417 aa  326  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.89 
 
 
447 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  46.73 
 
 
431 aa  317  4e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  46.32 
 
 
454 aa  310  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  46.43 
 
 
451 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  43.69 
 
 
428 aa  310  4e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  48.7 
 
 
418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.31 
 
 
441 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  44.44 
 
 
507 aa  275  9e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  33.77 
 
 
428 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.64 
 
 
404 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  33.24 
 
 
388 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  27.37 
 
 
393 aa  144  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.6 
 
 
387 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.58 
 
 
382 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.54 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.9 
 
 
386 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  27.91 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.67 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  28.03 
 
 
397 aa  134  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  29.33 
 
 
396 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  29.33 
 
 
396 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  29.33 
 
 
396 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  27.75 
 
 
382 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  28.5 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  29 
 
 
401 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.73 
 
 
472 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  29.61 
 
 
396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  27 
 
 
383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  25.89 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.86 
 
 
401 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  27.11 
 
 
398 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  27.4 
 
 
399 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  24.59 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  26.77 
 
 
392 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  24.73 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  26.51 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  26.13 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.97 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  26.12 
 
 
376 aa  113  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.76 
 
 
379 aa  113  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  28.46 
 
 
412 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  25.41 
 
 
376 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  37.8 
 
 
379 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  25.62 
 
 
376 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  24.34 
 
 
397 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  40.6 
 
 
393 aa  103  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  29.95 
 
 
402 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  26.56 
 
 
390 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>