More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4579 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
379 aa  738    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  70.18 
 
 
382 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  71.43 
 
 
376 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.58 
 
 
386 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  53.12 
 
 
379 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50.13 
 
 
387 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  50 
 
 
387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  54.67 
 
 
378 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.53 
 
 
404 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  47.3 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  45.62 
 
 
389 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.08 
 
 
391 aa  311  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  43.58 
 
 
376 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  45.75 
 
 
376 aa  309  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.55 
 
 
393 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  37.23 
 
 
396 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  37.23 
 
 
396 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  37.23 
 
 
396 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.66 
 
 
352 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  35.58 
 
 
396 aa  196  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  35.26 
 
 
392 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  34.62 
 
 
397 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  34.22 
 
 
385 aa  190  4e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  35 
 
 
392 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  35.08 
 
 
390 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  36.86 
 
 
383 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  36.01 
 
 
401 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.59 
 
 
382 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  35.15 
 
 
394 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.66 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.75 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  31.76 
 
 
393 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.02 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  35.2 
 
 
401 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.36 
 
 
390 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  35.93 
 
 
401 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.12 
 
 
390 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  35.41 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  34.97 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  34.97 
 
 
390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  36.5 
 
 
358 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  32.35 
 
 
398 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  34.07 
 
 
399 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  33.06 
 
 
428 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  31.5 
 
 
447 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  32.17 
 
 
388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.61 
 
 
400 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  30.93 
 
 
456 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.13 
 
 
420 aa  142  9e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  31.14 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.7 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  30.54 
 
 
456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  31.14 
 
 
450 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  30.14 
 
 
445 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  29.86 
 
 
454 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  31.66 
 
 
401 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  28.7 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  29.5 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  27.22 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.58 
 
 
408 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.58 
 
 
408 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  30.03 
 
 
415 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  31.13 
 
 
411 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  29.97 
 
 
455 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  27.81 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  32.07 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  29.97 
 
 
430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  32.07 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  30.03 
 
 
412 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  28.41 
 
 
383 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.11 
 
 
407 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  28.82 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.79 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  29.12 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  31.36 
 
 
388 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  30.68 
 
 
418 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  29.05 
 
 
402 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  29.87 
 
 
401 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  31.09 
 
 
398 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.15 
 
 
447 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  31.29 
 
 
417 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  30.77 
 
 
392 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  26.38 
 
 
493 aa  122  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  29.76 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  29.76 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  29.76 
 
 
401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  28.23 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.56 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.23 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  26.14 
 
 
395 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  29.63 
 
 
396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.15 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  29.13 
 
 
453 aa  119  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  27.58 
 
 
378 aa  119  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.52 
 
 
441 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  30.29 
 
 
401 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  30.69 
 
 
405 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  26.69 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  30.16 
 
 
460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  31.5 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>