More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3638 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  100 
 
 
431 aa  810    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  48.79 
 
 
443 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  47.78 
 
 
461 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  47.33 
 
 
463 aa  335  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  46.9 
 
 
462 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.9 
 
 
469 aa  332  6e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  46.64 
 
 
466 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  44.91 
 
 
483 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.27 
 
 
467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  48.64 
 
 
467 aa  327  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  46.82 
 
 
443 aa  327  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  49.35 
 
 
463 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.19 
 
 
471 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  45.77 
 
 
469 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.64 
 
 
469 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  46.74 
 
 
465 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.1 
 
 
441 aa  316  5e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  50.69 
 
 
449 aa  312  5.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.09 
 
 
469 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.09 
 
 
469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  44.87 
 
 
466 aa  309  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  50.62 
 
 
460 aa  308  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  45.05 
 
 
471 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  49.74 
 
 
432 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.51 
 
 
473 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  44.73 
 
 
454 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  44.73 
 
 
454 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  45.29 
 
 
453 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  44.36 
 
 
452 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  47.04 
 
 
447 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  46.72 
 
 
444 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  46.1 
 
 
450 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.15 
 
 
473 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  45.19 
 
 
456 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.25 
 
 
465 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  43.78 
 
 
455 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  45.76 
 
 
468 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  45.84 
 
 
428 aa  285  9e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.72 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  44.07 
 
 
456 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  47.98 
 
 
467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  44.44 
 
 
454 aa  283  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  44.08 
 
 
450 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  47.81 
 
 
418 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  45.45 
 
 
453 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  42.01 
 
 
442 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.15 
 
 
450 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  43.94 
 
 
450 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  39.96 
 
 
456 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  46.31 
 
 
417 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  45.55 
 
 
445 aa  259  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  42.93 
 
 
446 aa  259  9e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.42 
 
 
457 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  45.71 
 
 
451 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.9 
 
 
441 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  45.22 
 
 
454 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  44.44 
 
 
456 aa  249  9e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  47.06 
 
 
452 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.33 
 
 
447 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  42.21 
 
 
507 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  30.56 
 
 
376 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  31.87 
 
 
428 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  33.53 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  29.75 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.6 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  28.5 
 
 
393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.32 
 
 
386 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  28.72 
 
 
389 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.29 
 
 
393 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  31.56 
 
 
382 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  27 
 
 
385 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  26.9 
 
 
376 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.69 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28.37 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.02 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  28.33 
 
 
392 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.41 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  28.33 
 
 
392 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  27.25 
 
 
397 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  26.95 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  27.42 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.18 
 
 
396 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.18 
 
 
396 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.18 
 
 
396 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  27.24 
 
 
399 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.46 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.77 
 
 
379 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  27.11 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.88 
 
 
387 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.37 
 
 
390 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.38 
 
 
387 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  28.49 
 
 
397 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  24.87 
 
 
420 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  31.59 
 
 
412 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  31.84 
 
 
401 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  26.78 
 
 
376 aa  108  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.37 
 
 
390 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  23.93 
 
 
408 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  27.67 
 
 
398 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.63 
 
 
400 aa  106  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>