More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0153 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  72.38 
 
 		 469 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  100 
 
 		 466 aa  910    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  67.82 
 
 		 471 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  69.04 
 
 		 473 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  70.82 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  60.94 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  62.2 
 
 		 463 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  64.18 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  62.7 
 
 		 469 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  62.95 
 
 		 467 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  60.63 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0742  chromate transporter  59.87 
 
 		 461 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4736  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.96 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.16 
 
 		 469 aa  484  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.37 
 
 		 469 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  61.87 
 
 		 467 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  63.51 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2538  chromate transporter  60.96 
 
 		 465 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3131  chromate transporter  58.49 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3337  chromate transporter  58.49 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.27 
 
 		 441 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  59.01 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0300  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  57.05 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.178358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  53.85 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  48.61 
 
 		 453 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  48.69 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  48.03 
 
 		 456 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  48.28 
 
 		 450 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  48.9 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.51 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1532  chromate transporter  52.55 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  53.55 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.98 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  53.81 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  51.94 
 
 		 463 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  47.84 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  46.31 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4248  chromate transporter  53.59 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  47.15 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  47.66 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  51.39 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  49.89 
 
 		 449 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  51.24 
 
 		 456 aa  356  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.45 
 
 		 457 aa  355  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  46.24 
 
 		 456 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  48.55 
 
 		 445 aa  349  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  48.42 
 
 		 453 aa  346  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  45.14 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  48.28 
 
 		 432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  45.31 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  49.36 
 
 		 454 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.85 
 
 		 450 aa  325  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  46.67 
 
 		 447 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  47.2 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  44.87 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0797  chromate transporter  44.53 
 
 		 451 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  45.57 
 
 		 418 aa  300  4e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  42.62 
 
 		 428 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2656  chromate transporter  46.83 
 
 		 507 aa  281  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.92 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  31.61 
 
 		 428 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  32.12 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.23 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  27.84 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.57 
 
 		 387 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  27.3 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  27.2 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  27.2 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.19 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  26.92 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.27 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  27.2 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.32 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.89 
 
 		 387 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.72 
 
 		 472 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  24.88 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  26.22 
 
 		 389 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  27.6 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  26.23 
 
 		 397 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.08 
 
 		 386 aa  127  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  23.88 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.59 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  24.72 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.45 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  26.04 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  25.42 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  23.58 
 
 		 416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  22.76 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  25.07 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  25.69 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  25.69 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  25.69 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  29 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.09 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  27.25 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  36.57 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  23.85 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  39.58 
 
 		 393 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.11 
 
 		 391 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  28.9 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>