68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6264 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  100 
 
 		 336 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  53.19 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  57.1 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  51.26 
 
 		 314 aa  292  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  51.37 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  52.08 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  49.85 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  45.08 
 
 		 381 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  43.3 
 
 		 348 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  43.45 
 
 		 252 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  40.24 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  38.83 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  39.81 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  39.23 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  38.55 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  41.03 
 
 		 285 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  41.67 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  40 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  32.65 
 
 		 419 aa  149  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  34.14 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  35.21 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  35.5 
 
 		 396 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  33.15 
 
 		 362 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  32.6 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  31.71 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  33.33 
 
 		 268 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  34.58 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  32.3 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  32.3 
 
 		 252 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  32 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  31.6 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  30.64 
 
 		 279 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  31.25 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  32.65 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  32.29 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  30.72 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  30.9 
 
 		 251 aa  118  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  33.09 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  31.49 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  31.49 
 
 		 248 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  31.83 
 
 		 237 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  30.34 
 
 		 247 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  28.28 
 
 		 242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  29.83 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  31.19 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  31.85 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  31.38 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  31.38 
 
 		 247 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  29.11 
 
 		 261 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  29.35 
 
 		 262 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  29.93 
 
 		 258 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  29.87 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  29.21 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  27.36 
 
 		 265 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  32.53 
 
 		 248 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  29.62 
 
 		 249 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  30.03 
 
 		 255 aa  106  7e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  28.57 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  26.53 
 
 		 247 aa  103  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  28.67 
 
 		 245 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  26.27 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  35.48 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  28.35 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  27.02 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  23.59 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  24.31 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  26.87 
 
 		 251 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  31.48 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>