69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1964 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  67.61 
 
 
247 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  67.61 
 
 
247 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  63.97 
 
 
252 aa  347  8e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  63.56 
 
 
252 aa  347  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  68.09 
 
 
236 aa  344  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  62.55 
 
 
258 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  62.34 
 
 
249 aa  323  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  51.88 
 
 
253 aa  278  8e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  51.45 
 
 
242 aa  263  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  51.17 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  53.5 
 
 
237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  52.85 
 
 
247 aa  251  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  51.64 
 
 
243 aa  245  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  49.6 
 
 
268 aa  244  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  50.21 
 
 
262 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  48.59 
 
 
245 aa  238  9e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  47.62 
 
 
251 aa  236  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  49.21 
 
 
261 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  47.83 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  48.12 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  49.79 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  50.21 
 
 
247 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  47.41 
 
 
265 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  46.85 
 
 
250 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  45.75 
 
 
255 aa  225  4e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  47.15 
 
 
258 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  44.53 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  43.82 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  44.63 
 
 
262 aa  220  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  42.97 
 
 
248 aa  218  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  42.97 
 
 
248 aa  217  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  46.43 
 
 
248 aa  211  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  45.1 
 
 
261 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  44.36 
 
 
248 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  39.16 
 
 
335 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  33.51 
 
 
369 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  35.96 
 
 
396 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  33.66 
 
 
303 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  36.46 
 
 
286 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  33.76 
 
 
419 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  36.11 
 
 
285 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  36.11 
 
 
362 aa  164  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  34.11 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  36.33 
 
 
311 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  34.91 
 
 
325 aa  148  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  35.54 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  32.89 
 
 
301 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  34.77 
 
 
252 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  31.16 
 
 
279 aa  141  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  34.76 
 
 
295 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  34.3 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  34.39 
 
 
310 aa  138  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  31.4 
 
 
336 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  32.87 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  31.56 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  29.39 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  36.82 
 
 
290 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  30.61 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  30.48 
 
 
381 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  31.66 
 
 
348 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 
229 aa  98.6  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  52.17 
 
 
162 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  27.52 
 
 
240 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  29.82 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  29.95 
 
 
238 aa  79  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  32.64 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  24.23 
 
 
294 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  24.77 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>