60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0862 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  100 
 
 		 162 aa  326  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  82.83 
 
 		 261 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  78.79 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  66.02 
 
 		 248 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  61.32 
 
 		 250 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  65.56 
 
 		 261 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  61.7 
 
 		 335 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  43.62 
 
 		 362 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  57.45 
 
 		 254 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  52 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  53.54 
 
 		 419 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  52.75 
 
 		 279 aa  100  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  55.32 
 
 		 284 aa  99  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  37.58 
 
 		 369 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  50.96 
 
 		 243 aa  99  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  37.35 
 
 		 396 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  52.63 
 
 		 247 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  47.12 
 
 		 249 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  48.08 
 
 		 248 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  50 
 
 		 248 aa  95.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  47.37 
 
 		 247 aa  94.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  39.68 
 
 		 242 aa  94.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  53.06 
 
 		 251 aa  93.6  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  48.96 
 
 		 247 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  40.6 
 
 		 248 aa  90.5  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  52.17 
 
 		 247 aa  90.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  40.15 
 
 		 248 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  45.83 
 
 		 252 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  46.3 
 
 		 258 aa  87.8  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  45.83 
 
 		 252 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  42.99 
 
 		 249 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  44.44 
 
 		 255 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  46.08 
 
 		 245 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  46.08 
 
 		 247 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  52.33 
 
 		 236 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  44.57 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  45.74 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  45.1 
 
 		 268 aa  77.4  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  38.3 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  41.58 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  36.52 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  37.86 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  35.25 
 
 		 311 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  33.71 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  35.56 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  36.56 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  39.13 
 
 		 310 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  38.04 
 
 		 287 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  37.5 
 
 		 252 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  34.38 
 
 		 286 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  33.33 
 
 		 303 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  34.38 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  32.11 
 
 		 285 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  30 
 
 		 314 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  34.65 
 
 		 348 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  28.57 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  32.11 
 
 		 325 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  28.57 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  26.96 
 
 		 303 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  30.97 
 
 		 301 aa  41.2  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>