68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1160 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 
279 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  49.17 
 
 
237 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  50.84 
 
 
242 aa  250  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  45.7 
 
 
254 aa  249  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  43.41 
 
 
263 aa  245  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  46.25 
 
 
284 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  46.22 
 
 
243 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  47.3 
 
 
247 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  46.28 
 
 
245 aa  241  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  45.83 
 
 
255 aa  241  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  45.38 
 
 
251 aa  236  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  49.21 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  46.83 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  44.22 
 
 
248 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  48.77 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  49.18 
 
 
252 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  45.56 
 
 
248 aa  231  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  45.7 
 
 
261 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  45.31 
 
 
262 aa  228  8e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  44.54 
 
 
258 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  44.53 
 
 
249 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  44.62 
 
 
261 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  42.62 
 
 
268 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  43.82 
 
 
247 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  44.07 
 
 
262 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  42.23 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  42.11 
 
 
248 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  42.32 
 
 
247 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  43.37 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  43.27 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  42.97 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  42.74 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  41.39 
 
 
253 aa  210  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  43.46 
 
 
236 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  41.63 
 
 
248 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  32.04 
 
 
335 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  31.58 
 
 
369 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  30.84 
 
 
396 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  30.74 
 
 
362 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  32.57 
 
 
252 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  29.48 
 
 
419 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  32.13 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  33.62 
 
 
303 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  31.65 
 
 
303 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  33.62 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  32.34 
 
 
279 aa  135  9e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  32.76 
 
 
286 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  31.12 
 
 
295 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  29.64 
 
 
336 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  34.2 
 
 
290 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  27.3 
 
 
301 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  28.92 
 
 
348 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  28.68 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  33.89 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  33.88 
 
 
285 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  28.12 
 
 
314 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  29.29 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  32.91 
 
 
287 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  26.44 
 
 
381 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  52.75 
 
 
162 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  25.57 
 
 
357 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  26.74 
 
 
336 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  26.29 
 
 
294 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  27.56 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  36.08 
 
 
314 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  23.74 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  27.95 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>