69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1658 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  100 
 
 
336 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  64.11 
 
 
295 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  60.18 
 
 
325 aa  358  9e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  59.26 
 
 
303 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  57.1 
 
 
301 aa  339  5e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  56.97 
 
 
314 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  51.37 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  47.94 
 
 
348 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  47.55 
 
 
252 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  47.21 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  44.26 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  45.67 
 
 
303 aa  232  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  45.4 
 
 
286 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  44.51 
 
 
285 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  43.17 
 
 
285 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  36.68 
 
 
419 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  41.67 
 
 
310 aa  204  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  43.34 
 
 
287 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  43.7 
 
 
294 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  35.92 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  33.16 
 
 
369 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  31.74 
 
 
396 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  34.89 
 
 
263 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  34.77 
 
 
258 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  37.11 
 
 
237 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  33.98 
 
 
252 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  33.83 
 
 
262 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  33.98 
 
 
252 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  34.77 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  32.71 
 
 
243 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  35.71 
 
 
284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  36.53 
 
 
254 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  35.36 
 
 
268 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  34.75 
 
 
247 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  30.46 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  35.36 
 
 
248 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  35.74 
 
 
248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  31.4 
 
 
247 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  34.07 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  28.53 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  35.06 
 
 
249 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  34.98 
 
 
248 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  33.08 
 
 
255 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  29.64 
 
 
279 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  33.08 
 
 
245 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  32.35 
 
 
279 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  32.15 
 
 
311 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  31.5 
 
 
261 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  28.83 
 
 
249 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  33.73 
 
 
247 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  35.74 
 
 
248 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  30.56 
 
 
250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  30.74 
 
 
258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  33.85 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  29.32 
 
 
265 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  28.17 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  32.94 
 
 
248 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  28.31 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  31.23 
 
 
357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  30.2 
 
 
253 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  28.12 
 
 
236 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  36 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  24.9 
 
 
240 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  28.85 
 
 
238 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  25.93 
 
 
242 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  28.68 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  33.59 
 
 
251 aa  53.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  28.12 
 
 
162 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>