69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35810 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  88.56 
 
 
247 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  72.22 
 
 
252 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  71.79 
 
 
252 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  71.24 
 
 
258 aa  359  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  68.7 
 
 
249 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  68.09 
 
 
247 aa  344  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  52.79 
 
 
253 aa  278  7e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  57.39 
 
 
247 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  57.08 
 
 
243 aa  255  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  56.3 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  53.25 
 
 
242 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  53.94 
 
 
250 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  51.67 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  51.88 
 
 
254 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  53.48 
 
 
258 aa  241  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  50.2 
 
 
248 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  49.37 
 
 
245 aa  240  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  52.17 
 
 
249 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  50.61 
 
 
261 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  53.48 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  48.39 
 
 
265 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  52.81 
 
 
237 aa  237  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  50.87 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  51.3 
 
 
262 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  48.7 
 
 
262 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  47.74 
 
 
284 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  47.35 
 
 
248 aa  223  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  47.35 
 
 
248 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  48.55 
 
 
261 aa  219  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  47.01 
 
 
255 aa  218  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  48.57 
 
 
248 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  43.46 
 
 
279 aa  204  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  46.53 
 
 
248 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  39.43 
 
 
335 aa  185  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  39.56 
 
 
286 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  35.49 
 
 
303 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  38.46 
 
 
285 aa  166  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  33.43 
 
 
369 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  35.64 
 
 
303 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  34.85 
 
 
419 aa  158  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  35.97 
 
 
362 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  37.11 
 
 
311 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  34.2 
 
 
396 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  33.96 
 
 
279 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  35.08 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  32.97 
 
 
295 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  29.57 
 
 
357 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  32.85 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  33.91 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  33.33 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  32.85 
 
 
287 aa  116  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  32.86 
 
 
381 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  30.82 
 
 
301 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  31.38 
 
 
336 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  29.81 
 
 
325 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  28.12 
 
 
336 aa  104  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  32 
 
 
290 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  29.05 
 
 
348 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  33.06 
 
 
314 aa  99.8  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  34.16 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  52.33 
 
 
162 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  31.75 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  30.53 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  27.85 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  27.03 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  26.46 
 
 
294 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  25.45 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>