65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3756 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  100 
 
 
314 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  34.57 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  36.02 
 
 
396 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  32.18 
 
 
419 aa  116  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  30.75 
 
 
362 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  30.91 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  35.83 
 
 
325 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  33.81 
 
 
279 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  35.64 
 
 
314 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  37.5 
 
 
301 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  36 
 
 
336 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  33.85 
 
 
348 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  37.58 
 
 
295 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  35.48 
 
 
336 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  50 
 
 
252 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  29.39 
 
 
357 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  25.97 
 
 
247 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  36.43 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  29.37 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  25.16 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  34.87 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  25.16 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  26.3 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  27.86 
 
 
303 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  35.03 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  33.75 
 
 
285 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  47.5 
 
 
254 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  32.64 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  27.62 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  43.88 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  26.81 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  39.5 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  28.85 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  28.57 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  28.97 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  28.97 
 
 
248 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  24.39 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  40 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  33.55 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  38.94 
 
 
248 aa  67  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  31.58 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  34.36 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  36.08 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  27.03 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  30.67 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  31.4 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  27.03 
 
 
236 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  29.44 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  28.57 
 
 
245 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  39.36 
 
 
238 aa  64.3  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  26.52 
 
 
258 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  38.46 
 
 
247 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  28.57 
 
 
242 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  31.61 
 
 
268 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  39.13 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  25.11 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  32.74 
 
 
248 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  38.38 
 
 
251 aa  59.7  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  32.97 
 
 
242 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  36.96 
 
 
262 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  32.95 
 
 
240 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  33.63 
 
 
248 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  31.75 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  31.68 
 
 
253 aa  49.3  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  30.17 
 
 
251 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>