69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4973 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 		 252 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  97.62 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  73.25 
 
 		 247 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  71.54 
 
 		 247 aa  390  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  70.78 
 
 		 258 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  72.22 
 
 		 236 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  68.55 
 
 		 249 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  63.56 
 
 		 247 aa  347  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  53.19 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  54.69 
 
 		 248 aa  278  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  54.15 
 
 		 254 aa  273  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  54.62 
 
 		 242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  52.57 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  53.63 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  51.63 
 
 		 245 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  52.76 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  54.55 
 
 		 247 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  54.81 
 
 		 249 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  55.08 
 
 		 258 aa  262  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  52.36 
 
 		 248 aa  262  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  56.25 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  52.82 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  52.26 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  50.59 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  50.78 
 
 		 261 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  53.81 
 
 		 262 aa  254  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  52.96 
 
 		 250 aa  254  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  48.85 
 
 		 265 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  51.67 
 
 		 247 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  52.99 
 
 		 248 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  49.38 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  46.25 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  48.62 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  49.18 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  50.79 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  38.79 
 
 		 335 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  41.05 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  37.75 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  40.7 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  38.54 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  32.48 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  33.88 
 
 		 369 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  36.19 
 
 		 396 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  35.76 
 
 		 362 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  33.55 
 
 		 303 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  35.77 
 
 		 311 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  34.46 
 
 		 295 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  36.3 
 
 		 287 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  38.49 
 
 		 252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  34.17 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  38.08 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  35.29 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  34.81 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  33.33 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  34.51 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  31.04 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  36.58 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  31.97 
 
 		 336 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  29.64 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  32.17 
 
 		 381 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  33.33 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  30.14 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  28.9 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  45.92 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  29.72 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  25.16 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  28.22 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  26.05 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>