69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0327 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 		 237 aa  494  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  65.22 
 
 		 249 aa  328  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  60.94 
 
 		 243 aa  298  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  57.14 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  57.32 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  58.61 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  53.91 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  60.09 
 
 		 262 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  54.73 
 
 		 254 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  56.41 
 
 		 247 aa  275  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  58.7 
 
 		 263 aa  274  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  55.56 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  57.08 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  55.14 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  53.5 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  53.06 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  54.69 
 
 		 261 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  52.7 
 
 		 245 aa  261  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  54.35 
 
 		 258 aa  261  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  52.26 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  52.26 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  56.79 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  55.65 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  53.5 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  52.67 
 
 		 247 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  49.17 
 
 		 279 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  51.44 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  51.85 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  48.24 
 
 		 265 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  51.22 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  50 
 
 		 255 aa  241  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  51.05 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  52.81 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  49.21 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  43.16 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  37.99 
 
 		 335 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  38.78 
 
 		 419 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  40.79 
 
 		 396 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  39.59 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  36.29 
 
 		 369 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  40.35 
 
 		 362 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  36.36 
 
 		 357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  39.53 
 
 		 252 aa  161  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  35.44 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  35.92 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  38.26 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  39.3 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  37.69 
 
 		 325 aa  151  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  37.29 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  37.65 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  36.86 
 
 		 295 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  37.5 
 
 		 336 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  34.56 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  33.22 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  36.82 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  34.15 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  35.21 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  34.09 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  35.5 
 
 		 290 aa  128  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  31.38 
 
 		 336 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  33.95 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  52 
 
 		 162 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  32.56 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  29.96 
 
 		 294 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  32.42 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  28.17 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  29.37 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  29.17 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>