54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0793 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  29.63 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  31.18 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  28.02 
 
 		 335 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  31.02 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  30.34 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  26.67 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  26.87 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  27.62 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  25.85 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  25.93 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  28.7 
 
 		 250 aa  62  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  27.23 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  25.95 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  30.26 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  27.27 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  27.67 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  30.26 
 
 		 301 aa  58.5  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  24.77 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  29.32 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  26.05 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  26.05 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  28.27 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  25.52 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  24.72 
 
 		 357 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  29.89 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  25.45 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  25.45 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  27.32 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  29.24 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  29.17 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  33.6 
 
 		 336 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  26.42 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  21.35 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  22.48 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  24.77 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  24.66 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  27.89 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  26.09 
 
 		 311 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  25.6 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  22.84 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  26.87 
 
 		 336 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  22.83 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  24.61 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  53.66 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  29.22 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  26.57 
 
 		 247 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  37.5 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  30.56 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  30.17 
 
 		 314 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  24.18 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  22.37 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  48.78 
 
 		 303 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  28.04 
 
 		 310 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>