69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4766 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  100 
 
 
248 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  76.95 
 
 
251 aa  400  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  70.73 
 
 
248 aa  381  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  70.33 
 
 
248 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  67.61 
 
 
284 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  70.37 
 
 
254 aa  361  6e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  70.78 
 
 
248 aa  355  5e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  57.44 
 
 
242 aa  308  4e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  56.97 
 
 
243 aa  299  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  56.07 
 
 
249 aa  291  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  56.22 
 
 
250 aa  290  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  56.57 
 
 
261 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  54.69 
 
 
252 aa  279  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  54.69 
 
 
252 aa  278  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  54.07 
 
 
258 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  52.3 
 
 
263 aa  276  2e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  53.5 
 
 
237 aa  272  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  53.5 
 
 
262 aa  271  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  51.24 
 
 
262 aa  267  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  53.23 
 
 
249 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  54.03 
 
 
248 aa  262  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  50.21 
 
 
247 aa  259  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  50.39 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  51.39 
 
 
258 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  50.78 
 
 
247 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  51.17 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  49.61 
 
 
265 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  46.99 
 
 
245 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  52.16 
 
 
261 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  50.2 
 
 
236 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  48.81 
 
 
268 aa  240  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  46.75 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  44.22 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  44.08 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  45.97 
 
 
255 aa  224  7e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  36.25 
 
 
335 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  36.99 
 
 
419 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  33.97 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  36.59 
 
 
311 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  36.48 
 
 
396 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  39.11 
 
 
325 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  37.5 
 
 
286 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  35.81 
 
 
303 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  38.1 
 
 
287 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  37.16 
 
 
285 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  33.76 
 
 
303 aa  155  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  35.71 
 
 
362 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  38.31 
 
 
252 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  35.39 
 
 
301 aa  146  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  39.92 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  38.27 
 
 
303 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  38.43 
 
 
290 aa  142  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  39.59 
 
 
285 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  35.19 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  35.36 
 
 
336 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  36.63 
 
 
295 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  35.71 
 
 
381 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  32.13 
 
 
357 aa  131  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  35.16 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  32.67 
 
 
336 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  34.85 
 
 
348 aa  124  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  51.09 
 
 
162 aa  94  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  30 
 
 
242 aa  89  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  29.39 
 
 
238 aa  87  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  28.02 
 
 
294 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  26.73 
 
 
240 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  38.94 
 
 
314 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  25.93 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>