69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0049 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  89.07 
 
 		 247 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  88.56 
 
 		 236 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  73.66 
 
 		 252 aa  394  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  73.25 
 
 		 252 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  74.07 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  67.61 
 
 		 247 aa  360  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  68.62 
 
 		 249 aa  358  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  55.6 
 
 		 242 aa  271  8.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  51.28 
 
 		 253 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  55.2 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  55.79 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  53.36 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  54.96 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  51.39 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  50.39 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  51 
 
 		 254 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  49.4 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  53.36 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  52.28 
 
 		 258 aa  251  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  50 
 
 		 261 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  52.52 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  47.67 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  52.28 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  51.85 
 
 		 237 aa  245  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  49.61 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  50.62 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  48.24 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  49.59 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  48.44 
 
 		 248 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  47.15 
 
 		 255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  47.67 
 
 		 261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  49.8 
 
 		 248 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  47.06 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  42.97 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  38.91 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  38.7 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  36.09 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  37.54 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  32.88 
 
 		 369 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  32.29 
 
 		 419 aa  169  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  35.22 
 
 		 303 aa  165  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  36.11 
 
 		 362 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  34.38 
 
 		 396 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  35.93 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  36.22 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  32.65 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  33.69 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  34.95 
 
 		 310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  33.92 
 
 		 287 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  33.79 
 
 		 285 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  34.66 
 
 		 303 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  29.13 
 
 		 357 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  32.12 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  31.13 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  32.09 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  28.17 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  33.85 
 
 		 314 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  34.03 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  30.34 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  28.11 
 
 		 348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  48.96 
 
 		 162 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  31.28 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  25.97 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  30.7 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  28.11 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  24.91 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  24.77 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>