68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3369 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 		 265 aa  544  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  73.91 
 
 		 261 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  63.92 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  56 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  50.97 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  50 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  48.85 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  48.28 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  49.61 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  48.64 
 
 		 247 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  47.67 
 
 		 247 aa  248  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  48.65 
 
 		 251 aa  248  9e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  49.61 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  50.2 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  48.24 
 
 		 237 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  47.45 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  47.83 
 
 		 284 aa  242  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  48.39 
 
 		 236 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  49.21 
 
 		 279 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  46.06 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  47.43 
 
 		 249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  45.85 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  47.41 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  45.06 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  43.43 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  44.27 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  45.12 
 
 		 253 aa  218  6e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  46.25 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  43.25 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  44.05 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  43.43 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  43.65 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  35.69 
 
 		 335 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  40.23 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  42.91 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  42.46 
 
 		 245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  32.1 
 
 		 369 aa  184  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  35.5 
 
 		 362 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  34.28 
 
 		 419 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  33.96 
 
 		 396 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  78.79 
 
 		 162 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  35.35 
 
 		 311 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  32.64 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  31.94 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  32.49 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  31.58 
 
 		 303 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  31.46 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  35.02 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  29.38 
 
 		 357 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  32.81 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  31.44 
 
 		 301 aa  129  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  32.42 
 
 		 348 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  32.43 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  29.69 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  30.74 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  31.6 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  29.32 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  30.27 
 
 		 325 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  31.03 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  31.02 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  29.05 
 
 		 381 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  27.36 
 
 		 336 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  27.62 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  29.3 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  29.63 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  29.79 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  24.39 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>