65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4988 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 		 294 aa  607  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  42.37 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  44.22 
 
 		 336 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  41.76 
 
 		 348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  44.77 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  39.1 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  41.18 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  37.63 
 
 		 325 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  41.06 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  39.64 
 
 		 336 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  38.55 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  35.14 
 
 		 381 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  36.33 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  35.55 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  36.44 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  36.78 
 
 		 310 aa  132  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  34.16 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  33.47 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  29.96 
 
 		 237 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  29.3 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  28.66 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  31.38 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  28.46 
 
 		 243 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  29.8 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  27.69 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  27.59 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  29.96 
 
 		 248 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  29.55 
 
 		 263 aa  85.5  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  30.61 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  28.51 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  27.87 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  27.34 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  27.78 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  29.43 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  29.53 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  27.76 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  28.02 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  29.05 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  26.3 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  27.74 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  26.29 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  26.94 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  28.45 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  26.27 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  26.89 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  27.67 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  28.22 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  27.05 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  27.08 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  25.38 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  24.85 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  24.61 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  26.48 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  26.39 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  24.32 
 
 		 248 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  26.32 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  26.75 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  25.24 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  25.48 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  24.57 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  24.91 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  26.46 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  24.23 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  23.15 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  27.17 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>