69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2516 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 		 252 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  97.62 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  73.66 
 
 		 247 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  71.14 
 
 		 247 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  71.19 
 
 		 258 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  69.64 
 
 		 249 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  71.79 
 
 		 236 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  63.97 
 
 		 247 aa  347  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  52.77 
 
 		 253 aa  282  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  54.69 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  53.75 
 
 		 254 aa  272  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  53.36 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  54.03 
 
 		 268 aa  271  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  52.44 
 
 		 245 aa  270  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  53.66 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  53.33 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  54.96 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  53.15 
 
 		 248 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  54.81 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  56.25 
 
 		 243 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  51.94 
 
 		 261 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  53.23 
 
 		 263 aa  260  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  54.66 
 
 		 258 aa  260  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  52.26 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  53.36 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  52.92 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  54.24 
 
 		 262 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  49.8 
 
 		 284 aa  255  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  50 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  53.39 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  49.41 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  47.41 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  49.79 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  48.77 
 
 		 279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  51.19 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  38.48 
 
 		 335 aa  205  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  41.4 
 
 		 285 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  38.08 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  41.05 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  38.87 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  32.74 
 
 		 419 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  33.88 
 
 		 369 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  36.19 
 
 		 396 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  35.76 
 
 		 362 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  33.55 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  36.46 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  34.46 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  36.05 
 
 		 310 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  36.3 
 
 		 287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  38.49 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  36.3 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  38.46 
 
 		 325 aa  151  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  34.52 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  33.44 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  34.51 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  31.34 
 
 		 357 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  35.94 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  31.97 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  29.64 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  32.52 
 
 		 381 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  33.33 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  29.36 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  30.14 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  45.92 
 
 		 162 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  29.32 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  29.05 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  25.16 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  26.05 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>