70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4221 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 		 286 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  95.77 
 
 		 285 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  78.22 
 
 		 303 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  76.39 
 
 		 303 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  50.98 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  49.33 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  48.29 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  45.37 
 
 		 314 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  44.81 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  45.12 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  46.67 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  46 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  41.23 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  43.94 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  44.19 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  41.05 
 
 		 252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  40.7 
 
 		 252 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  39.95 
 
 		 381 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  39.65 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  38.7 
 
 		 247 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  38.71 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  37.89 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  39.56 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  42.04 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  41.67 
 
 		 336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  41.63 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  36.46 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  36.33 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  38.54 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  36.88 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  35.34 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  36.97 
 
 		 258 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  37.5 
 
 		 248 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  36.07 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  35.92 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  36.59 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  36.18 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  35.94 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  32.64 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  32.95 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  39.57 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  36.45 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  35.19 
 
 		 369 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  36.33 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  34.86 
 
 		 247 aa  152  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  33.25 
 
 		 396 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  36.4 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  32.99 
 
 		 245 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  32.03 
 
 		 249 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  36.33 
 
 		 294 aa  145  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  31.82 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  35.86 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  36.79 
 
 		 248 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  34.38 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  33.1 
 
 		 247 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  32.75 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  32.76 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  31.62 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  31.49 
 
 		 240 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  30.83 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  31.95 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  31.08 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  31.14 
 
 		 311 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  28.38 
 
 		 242 aa  96.3  5e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  28.94 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  34.87 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  34.38 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2933  hypothetical protein  84 
 
 		 192 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  22.83 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>