70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3808 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3808  Gp37Gp68 family protein  100 
 
 
303 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5105  Gp37Gp68 family protein  77.23 
 
 
303 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4221  Gp37Gp68 family protein  78.22 
 
 
286 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6966  Gp37Gp68 family protein  78.48 
 
 
285 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3106  putative phage protein Gp37Gp68  50.49 
 
 
303 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0083957  decreased coverage  0.0000124702 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2495  Gp37Gp68 family protein  58.01 
 
 
252 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116311  normal  0.247592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1672  phage Gp37Gp68 family protein  46.55 
 
 
325 aa  241  9e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3331  phage Gp37Gp68 family protein  47.62 
 
 
314 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1658  gp38  47.21 
 
 
336 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000388971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1924  Gp37Gp68 family protein  49.51 
 
 
295 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2170  Gp37Gp68 family protein  46.52 
 
 
287 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.46933  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1073  phage Gp37Gp68  45.89 
 
 
310 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00971821  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4472  phage Gp37Gp68  41.11 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4728  Gp37Gp68 family protein  45.14 
 
 
285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3655  phage Gp37Gp68 family protein  43.48 
 
 
301 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0278  hypothetical protein  38.95 
 
 
381 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0501277  normal  0.0739994 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2516  Gp37Gp68 family protein  38.87 
 
 
252 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237707  normal  0.484258 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4973  Gp37Gp68 family protein  38.54 
 
 
252 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18502 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6264  phage Gp37Gp68  40.24 
 
 
336 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0584  Gp37Gp68 family protein  36.73 
 
 
263 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6140  Gp37Gp68 family protein  43.29 
 
 
268 aa  170  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3059  phage Gp37Gp68 family protein  35.55 
 
 
247 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6271  Gp37Gp68 family protein  36.45 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3720  Gp37Gp68 family protein  36.33 
 
 
249 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.55464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0049  hypothetical protein  35.22 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0598  phage Gp37Gp68  35.08 
 
 
250 aa  163  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4879  phage Gp37Gp68 family protein  41.8 
 
 
248 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2090  phage Gp37Gp68 family protein  34.88 
 
 
258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0446889  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1964  hypothetical protein  34.11 
 
 
247 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4766  phage Gp37Gp68 family protein  35.81 
 
 
248 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.816863  normal  0.811783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1048  phage Gp37Gp68 family protein  41.39 
 
 
248 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.657048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1493  phage Gp37Gp68 family protein  32.89 
 
 
243 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35810  hypothetical protein  35.64 
 
 
236 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167759  decreased coverage  3.3273e-20 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4082  Gp37Gp68 family protein  35.05 
 
 
261 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0327  Gp37Gp68 family protein  39.3 
 
 
237 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4338  Gp37Gp68 family protein  33.67 
 
 
262 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3795  hypothetical protein  34.11 
 
 
369 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0599  Gp37Gp68 family protein  37.39 
 
 
247 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1516  phage Gp37Gp68  34.11 
 
 
258 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0217342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0170  Phage Gp37Gp68  38.67 
 
 
262 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00797438  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12747  hypothetical protein  34.52 
 
 
284 aa  153  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000243041  normal  0.097324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2095  phage Gp37Gp68  37.96 
 
 
245 aa  153  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.192237  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1728  phage Gp37Gp68 family protein  31.97 
 
 
396 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.251141  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4988  Gp37Gp68 family protein  38.55 
 
 
294 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2838  Phage Gp37Gp68  38.53 
 
 
255 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2717  Phage Gp37Gp68  37.13 
 
 
261 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09620  bacteriophage protein gp37  34.19 
 
 
251 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3369  Gp37Gp68 family protein  31.46 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.24091  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1598  phage Gp37Gp68 family protein  36.44 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.265251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2736  Gp37Gp68 family protein  29.83 
 
 
335 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0231  Gp37Gp68 family protein  31.31 
 
 
249 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1564  phage Gp37Gp68  31.17 
 
 
419 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1921  phage Gp37Gp68 family protein  37.77 
 
 
248 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209387  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1160  Gp37Gp68 family protein  33.62 
 
 
279 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1431  phage Gp37Gp68 family protein  35.48 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.493737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0280  Gp37Gp68 family protein  37.55 
 
 
247 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3680  ABC transporter  33.62 
 
 
242 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016311  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5744  Gp37Gp68 family protein  31.82 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2421  Gp37Gp68 family protein  30.59 
 
 
357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.139852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0762  hypothetical protein  31.53 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0799  Gp37Gp68 family protein  31.01 
 
 
279 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0471  Gp37Gp68 family protein  31.53 
 
 
238 aa  100  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.355341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3041  Gp37Gp68 family protein  29.27 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00607224  normal  0.308879 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0310  phage protein Gp37/Gp68  27.8 
 
 
242 aa  94.7  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0551535  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4221  Gp37Gp68 family protein  29.32 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1720  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3756  phage Gp37Gp68 family protein  31.4 
 
 
314 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.739268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2933  hypothetical protein  92 
 
 
192 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0862  Phage Gp37Gp68  33.33 
 
 
162 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0793  hypothetical protein  24.18 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.476319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>