16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6236 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6236  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.762769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1602  hypothetical protein  61.08 
 
 		 213 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5243  hypothetical protein  61.08 
 
 		 213 aa  277  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6524  hypothetical protein  58.29 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5594  hypothetical protein  55.92 
 
 		 211 aa  249  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5025  hypothetical protein  41.88 
 
 		 212 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.707779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5506  hypothetical protein  40.61 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.630796 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5067  hypothetical protein  36.36 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1658  hypothetical protein  40.72 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3628  hypothetical protein  37.89 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.799442  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1596  hypothetical protein  33.5 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2537  hypothetical protein  34.98 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4406  hypothetical protein  36.46 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4297  hypothetical protein  32.95 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.332002 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5192  hypothetical protein  38.54 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.374053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0539  hypothetical protein  47.06 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>