16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5506 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5506  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.630796 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1602  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293024  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5243  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  157  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6236  hypothetical protein  40.61 
 
 
213 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.762769 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5025  hypothetical protein  40.91 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.707779  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5594  hypothetical protein  41.88 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1658  hypothetical protein  42.79 
 
 
261 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6524  hypothetical protein  40.84 
 
 
211 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5067  hypothetical protein  36.17 
 
 
206 aa  138  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3628  hypothetical protein  34.55 
 
 
208 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.799442  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4406  hypothetical protein  36.27 
 
 
209 aa  110  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4297  hypothetical protein  31.63 
 
 
214 aa  99  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.332002 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5192  hypothetical protein  36.9 
 
 
249 aa  82  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.374053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2537  hypothetical protein  29.41 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1596  hypothetical protein  27.51 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0539  hypothetical protein  31.07 
 
 
217 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>