15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4297 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4297  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.332002 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5067  hypothetical protein  38.05 
 
 
206 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6524  hypothetical protein  36.78 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5594  hypothetical protein  35.06 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1602  hypothetical protein  31.52 
 
 
213 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293024  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5243  hypothetical protein  31.52 
 
 
213 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6236  hypothetical protein  32.95 
 
 
213 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.762769 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3628  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.799442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1658  hypothetical protein  32.63 
 
 
261 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2537  hypothetical protein  32.43 
 
 
234 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5506  hypothetical protein  31.63 
 
 
197 aa  99  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.630796 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1596  hypothetical protein  28.72 
 
 
238 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4406  hypothetical protein  36.94 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5025  hypothetical protein  32.16 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.707779  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5192  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.374053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>