16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1596 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1596  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2537  hypothetical protein  61.16 
 
 
234 aa  261  4.999999999999999e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1602  hypothetical protein  33.65 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293024  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5243  hypothetical protein  33.65 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6236  hypothetical protein  33.5 
 
 
213 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.762769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1658  hypothetical protein  35.5 
 
 
261 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5594  hypothetical protein  32 
 
 
211 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6524  hypothetical protein  33 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5067  hypothetical protein  33.16 
 
 
206 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4406  hypothetical protein  33.51 
 
 
209 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3628  hypothetical protein  29.21 
 
 
208 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.799442  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5025  hypothetical protein  34.64 
 
 
212 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.707779  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4297  hypothetical protein  28.72 
 
 
214 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.332002 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5506  hypothetical protein  27.51 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.630796 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5192  hypothetical protein  28.91 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.374053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0539  hypothetical protein  32.47 
 
 
217 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>