16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5025 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_5025  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.707779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1602  hypothetical protein  42.72 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5243  hypothetical protein  42.72 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6524  hypothetical protein  41.54 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6236  hypothetical protein  41.88 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.762769 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5506  hypothetical protein  40.91 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.630796 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5594  hypothetical protein  38.46 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3628  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.799442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1658  hypothetical protein  40.5 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4406  hypothetical protein  38.07 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5067  hypothetical protein  34.64 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1596  hypothetical protein  34.64 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2537  hypothetical protein  32.4 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5192  hypothetical protein  38.42 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.374053 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4297  hypothetical protein  32.16 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.332002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0539  hypothetical protein  37.88 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>