17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1658 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1658  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  531  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5243  hypothetical protein  41.33 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1602  hypothetical protein  41.33 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3628  hypothetical protein  41 
 
 		 208 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.799442  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5506  hypothetical protein  42.79 
 
 		 197 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.630796 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6236  hypothetical protein  40.72 
 
 		 213 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.762769 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5594  hypothetical protein  40.21 
 
 		 211 aa  139  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5025  hypothetical protein  40.5 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.707779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6524  hypothetical protein  39.69 
 
 		 211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4406  hypothetical protein  36.18 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5067  hypothetical protein  35.23 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2537  hypothetical protein  35.64 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1596  hypothetical protein  35.5 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4297  hypothetical protein  32.63 
 
 		 214 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.332002 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5192  hypothetical protein  37.06 
 
 		 249 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.374053 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0068  hypothetical protein  32 
 
 		 198 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.533931  normal  0.463974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0539  hypothetical protein  42.31 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>