31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6227 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  70.85 
 
 		 322 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  67.71 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  66.04 
 
 		 321 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  64.26 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  63.32 
 
 		 322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  59.15 
 
 		 329 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  59.35 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  61.06 
 
 		 342 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  62.22 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  60 
 
 		 322 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  56.36 
 
 		 330 aa  373  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  56.06 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  55.72 
 
 		 342 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  46.37 
 
 		 312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  45.22 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  66.67 
 
 		 135 aa  180  4e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  34.06 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  43.7 
 
 		 119 aa  102  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  25.23 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  24.84 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  27.33 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  23.1 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  24.69 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  25.08 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  26.32 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  25.94 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  24.9 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  36.45 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  23.92 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  24.11 
 
 		 334 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>