20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1539 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  201  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  83.16 
 
 
325 aa  163  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  41.67 
 
 
318 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  37.61 
 
 
342 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  36.52 
 
 
342 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  37.61 
 
 
322 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  36.45 
 
 
324 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  35.78 
 
 
329 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  37.61 
 
 
322 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  37.86 
 
 
322 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  38.71 
 
 
330 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  36.96 
 
 
304 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  35.92 
 
 
322 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  33.98 
 
 
321 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  35.48 
 
 
330 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  36.59 
 
 
334 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  35.92 
 
 
322 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  33.98 
 
 
322 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  31.31 
 
 
350 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0643661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>