31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3683 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  82.92 
 
 
321 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  81.37 
 
 
322 aa  542  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  80.37 
 
 
322 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  78.82 
 
 
322 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  63.32 
 
 
324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  61.56 
 
 
322 aa  394  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  62.19 
 
 
342 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  62.7 
 
 
322 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  57.36 
 
 
329 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  55.96 
 
 
330 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  53.55 
 
 
342 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  55.35 
 
 
330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  58.2 
 
 
318 aa  354  8.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  44.62 
 
 
304 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  42.81 
 
 
312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  65.89 
 
 
135 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  26.2 
 
 
350 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  25 
 
 
350 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  31.46 
 
 
325 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  27.74 
 
 
334 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  25.77 
 
 
395 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  25.38 
 
 
357 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  37.29 
 
 
119 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  24.75 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  26.41 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  27.2 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  26.06 
 
 
335 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  26.94 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  27.23 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  37.86 
 
 
100 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>