28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1721 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  94.93 
 
 		 335 aa  660    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  29.3 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  28.45 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  26.45 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  25.99 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  26.76 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  27.15 
 
 		 342 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  27.95 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  26.62 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  23.85 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  26.06 
 
 		 322 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  26.15 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  25.76 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  21.1 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  25.26 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  25.1 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  25.31 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  25.71 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  25.31 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  24.9 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  23.72 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  24.82 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  24.79 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  23.24 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  26.94 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  22.71 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  23.43 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>