29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3609 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  100 
 
 		 395 aa  823    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  40.52 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  34.62 
 
 		 334 aa  143  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  37.5 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  29.9 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  32.39 
 
 		 334 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  29.35 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  30.72 
 
 		 357 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  29.55 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  29.97 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  29.62 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  32.04 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  28.66 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  25.77 
 
 		 322 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  32.76 
 
 		 304 aa  99  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  26.83 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  26.48 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  27.3 
 
 		 329 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  26.89 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  27.23 
 
 		 322 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  27.17 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  24.83 
 
 		 322 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  24.85 
 
 		 330 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  26.15 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  23.1 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  26.43 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  26.32 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  25.99 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  32.52 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>