31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1184 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  90.68 
 
 		 342 aa  603  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  91.03 
 
 		 322 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  66.47 
 
 		 342 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  64.76 
 
 		 329 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  62.85 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  62.81 
 
 		 322 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  61.56 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  62.19 
 
 		 321 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  60.44 
 
 		 322 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  56.97 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  60.19 
 
 		 324 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  57.1 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  60.13 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  48.53 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  44.65 
 
 		 312 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  68.7 
 
 		 135 aa  185  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  29.55 
 
 		 395 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  26.58 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  31.82 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  27.95 
 
 		 357 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  27.3 
 
 		 334 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  41.18 
 
 		 119 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  25.8 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  26.97 
 
 		 329 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  26.99 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  26.64 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  25.83 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  24.92 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  37.61 
 
 		 100 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  25.23 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>