17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0865 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  245  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  93.28 
 
 		 330 aa  231  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  91.6 
 
 		 330 aa  229  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  49.58 
 
 		 329 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  46.28 
 
 		 342 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  42.86 
 
 		 342 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  43.7 
 
 		 324 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  47.66 
 
 		 318 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  41.18 
 
 		 322 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  46.61 
 
 		 322 aa  100  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  42.2 
 
 		 322 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  43.22 
 
 		 321 aa  95.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  39.32 
 
 		 322 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  40 
 
 		 322 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  37.29 
 
 		 322 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  35.34 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  46.58 
 
 		 304 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>