30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3686 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  59.68 
 
 
304 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  46.37 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  44.84 
 
 
322 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  44.48 
 
 
321 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  43.37 
 
 
322 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  44.12 
 
 
322 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  46.23 
 
 
318 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  44.65 
 
 
322 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  45.6 
 
 
322 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  44.69 
 
 
342 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  43.52 
 
 
330 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  41.28 
 
 
342 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  42.99 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  42.81 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  43.95 
 
 
329 aa  239  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  52.94 
 
 
135 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  28.53 
 
 
350 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  29.6 
 
 
350 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  32.04 
 
 
395 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  27.54 
 
 
357 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  31.07 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  26.48 
 
 
329 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  26.23 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  29.86 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  27.95 
 
 
334 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  35.34 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  26.25 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  25.1 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  24.22 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>