31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0601 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  100 
 
 		 342 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  66.47 
 
 		 322 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  65.88 
 
 		 342 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  62.17 
 
 		 329 aa  429  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  65.06 
 
 		 322 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  56.01 
 
 		 330 aa  391  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  56.56 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  56.05 
 
 		 321 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  54.87 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  55.75 
 
 		 322 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  54.73 
 
 		 322 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  55.72 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  53.55 
 
 		 322 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  50.61 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  42.69 
 
 		 304 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  41.28 
 
 		 312 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  65.69 
 
 		 135 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  27.97 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  46.28 
 
 		 119 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  28.66 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  29.74 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  26.23 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  25.08 
 
 		 350 aa  96.3  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  25.07 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  25.94 
 
 		 329 aa  86.3  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  25.97 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  27.81 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  24.7 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  36.52 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  22.7 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  22.71 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>