29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1581 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  673    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  74.25 
 
 		 334 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  53.13 
 
 		 329 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  43.53 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  32.23 
 
 		 395 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  29.9 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  33.86 
 
 		 350 aa  122  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  33.53 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  30.04 
 
 		 334 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  26.76 
 
 		 335 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  27.95 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  26.19 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  32.03 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  29.28 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  27.43 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  27.5 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  30.04 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  29.6 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  30.53 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  24.58 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  27.4 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  24.92 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  28.63 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  26.37 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  24.84 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  25.23 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  25.65 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3270  hypothetical protein  23.38 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336359  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  24.11 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>