31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2355 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  92.73 
 
 
330 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  688    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  58.43 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  56.56 
 
 
342 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  58.36 
 
 
322 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  59.02 
 
 
321 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  58.54 
 
 
322 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  57.49 
 
 
322 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  58.79 
 
 
342 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  56.97 
 
 
322 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  56.36 
 
 
324 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  57.81 
 
 
322 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  55.96 
 
 
322 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  52.83 
 
 
318 aa  335  7e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  96.18 
 
 
135 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  43.52 
 
 
312 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  43.03 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  93.28 
 
 
119 aa  231  1e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  30.25 
 
 
325 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  25.97 
 
 
334 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  30.56 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  26.38 
 
 
350 aa  89.4  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  24.85 
 
 
395 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  26.28 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  24.68 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  24.79 
 
 
335 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  24.15 
 
 
335 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  24.27 
 
 
334 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  23.55 
 
 
334 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  38.71 
 
 
100 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  26.2 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>