31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2496 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  90.68 
 
 		 322 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  90.38 
 
 		 322 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  65.88 
 
 		 342 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  65.05 
 
 		 329 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  64.09 
 
 		 322 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  63.75 
 
 		 322 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  62.19 
 
 		 322 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  62.19 
 
 		 321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  60.68 
 
 		 322 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  58.79 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  58.61 
 
 		 330 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  61.06 
 
 		 324 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  58.71 
 
 		 318 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  47.63 
 
 		 304 aa  291  9e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  44.69 
 
 		 312 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0862  hypothetical protein  68.7 
 
 		 135 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.15888  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  29.97 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  28.75 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  29.02 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  31.91 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0865  hypothetical protein  42.86 
 
 		 119 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334023  normal  0.973022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  27.03 
 
 		 350 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  27.46 
 
 		 334 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  27.3 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  27.08 
 
 		 335 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  27.15 
 
 		 335 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  25.41 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  25.65 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1539  hypothetical protein  37.61 
 
 		 100 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  27.27 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>