29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2258 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  676    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  74.25 
 
 
334 aa  476  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  51.86 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  46.36 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  34.62 
 
 
395 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  31.01 
 
 
357 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  29.73 
 
 
350 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  34.78 
 
 
350 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  32.92 
 
 
334 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  31.3 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  26.45 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  30.36 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  28.57 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  29.86 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  29.48 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  28.62 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  27.59 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  25.4 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  27.69 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  28.39 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  27.61 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  25.24 
 
 
342 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  27.71 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  25.55 
 
 
329 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  30.73 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  26.07 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  23.87 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3270  hypothetical protein  24.19 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336359  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  23.45 
 
 
330 aa  56.2  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0243174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>