31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_9010 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  100 
 
 		 329 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1581  hypothetical protein  53.13 
 
 		 334 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2258  hypothetical protein  51.86 
 
 		 334 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5537  hypothetical protein  44.15 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196835  hitchhiker  0.0000686352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3609  phage/plasmid-related protein TIGR03299  40.52 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00236551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2365  phage/plasmid-related protein  28.41 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2980  hypothetical protein  30 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0949  phage/plasmid-related protein  27.03 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0643661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0312  phage/plasmid-related protein  29.3 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3551  hypothetical protein  32.62 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3686  hypothetical protein  26.48 
 
 		 312 aa  90.5  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1656  hypothetical protein  24.25 
 
 		 318 aa  88.2  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.860571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4742  hypothetical protein  28.03 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4304  hypothetical protein  25.76 
 
 		 304 aa  86.7  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126034  normal  0.2404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0601  phage/plasmid-related protein  25.94 
 
 		 342 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1184  hypothetical protein  26.97 
 
 		 322 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.818215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2496  hypothetical protein  27.3 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0111  hypothetical protein  26.05 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6227  hypothetical protein  25.08 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0256712  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0205  hypothetical protein  25.74 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2725  hypothetical protein  24.74 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3683  hypothetical protein  24.75 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2449  hypothetical protein  23.89 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3659  hypothetical protein  23.53 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1721  hypothetical protein  23.85 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.117642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3270  hypothetical protein  23.32 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336359  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2355  hypothetical protein  24.68 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.78764  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1621  hypothetical protein  23.68 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0243174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2577  hypothetical protein  23.81 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  31.76 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  30.48 
 
 		 3094 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>