72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4210 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  569  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  70.55 
 
 		 275 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  70.55 
 
 		 275 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  68.86 
 
 		 273 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  67.64 
 
 		 275 aa  400  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  68.84 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  68.36 
 
 		 275 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  68.84 
 
 		 276 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  68.73 
 
 		 274 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  68.75 
 
 		 274 aa  394  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  68.86 
 
 		 274 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  67.27 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  68.48 
 
 		 276 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  68 
 
 		 275 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  67.51 
 
 		 277 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  67.87 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  67.64 
 
 		 274 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  68.12 
 
 		 276 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  66.91 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  69.09 
 
 		 274 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  69.45 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  65.58 
 
 		 277 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  68.73 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  68.73 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  69.09 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  69.09 
 
 		 274 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  69.96 
 
 		 274 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  65.07 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  65.31 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  65.45 
 
 		 275 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  64 
 
 		 275 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  66.54 
 
 		 275 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  65.19 
 
 		 275 aa  363  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  61.57 
 
 		 287 aa  340  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  60.07 
 
 		 273 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  55.31 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  54.95 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  56.83 
 
 		 272 aa  331  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  58.93 
 
 		 295 aa  330  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  58.21 
 
 		 273 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  56.93 
 
 		 273 aa  325  5e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  57.56 
 
 		 273 aa  321  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  58.96 
 
 		 273 aa  317  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  58.36 
 
 		 273 aa  316  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  50.73 
 
 		 273 aa  296  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  53.53 
 
 		 272 aa  292  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  53.9 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  53.9 
 
 		 272 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  53.9 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  53.16 
 
 		 272 aa  288  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  53.16 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  54.07 
 
 		 273 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  52.79 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  53.16 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  53.33 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  53.36 
 
 		 315 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  50.19 
 
 		 287 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  47.65 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  49.43 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  45.49 
 
 		 312 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  45.1 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  63.58 
 
 		 196 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  43.46 
 
 		 266 aa  229  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  59.54 
 
 		 196 aa  225  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  58.38 
 
 		 197 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  70.73 
 
 		 123 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  66.67 
 
 		 123 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  64.52 
 
 		 124 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  36.4 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  36.7 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  36.12 
 
 		 283 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9010  phage/plasmid-related protein  31.76 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.106896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>