71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1244 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  98.54 
 
 
274 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  97.45 
 
 
274 aa  534  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  97.81 
 
 
274 aa  534  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  93.43 
 
 
274 aa  531  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  97.45 
 
 
274 aa  528  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  92.34 
 
 
274 aa  524  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  89.09 
 
 
275 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  86.96 
 
 
276 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  85.51 
 
 
276 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  84.78 
 
 
276 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  84.78 
 
 
276 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  86.08 
 
 
274 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  86.55 
 
 
275 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  85.09 
 
 
275 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  85.09 
 
 
275 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  84 
 
 
275 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  84.62 
 
 
274 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  81.09 
 
 
275 aa  464  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  77.45 
 
 
275 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  78.55 
 
 
275 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  74.18 
 
 
275 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  66.43 
 
 
277 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  63.18 
 
 
277 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  64.26 
 
 
277 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  68.73 
 
 
274 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  63.27 
 
 
275 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  61.82 
 
 
273 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  64.34 
 
 
274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  53.28 
 
 
273 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  52.92 
 
 
273 aa  328  6e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  58.01 
 
 
295 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  57.2 
 
 
272 aa  324  9e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  60 
 
 
278 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  61.13 
 
 
275 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  56.23 
 
 
287 aa  322  4e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  61.13 
 
 
275 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  59.34 
 
 
278 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  58.05 
 
 
273 aa  318  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  56.13 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  54.04 
 
 
273 aa  311  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  57.84 
 
 
273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  55.35 
 
 
273 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  54.28 
 
 
273 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  54.31 
 
 
315 aa  295  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  54.28 
 
 
273 aa  295  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  54.65 
 
 
272 aa  295  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  52.79 
 
 
273 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  53.9 
 
 
272 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  53.9 
 
 
272 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  53.9 
 
 
272 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  53.53 
 
 
272 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  53.16 
 
 
272 aa  290  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  50.18 
 
 
273 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  53.9 
 
 
272 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  53.16 
 
 
272 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  50.37 
 
 
287 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  45.49 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  47.73 
 
 
316 aa  242  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  62.64 
 
 
196 aa  237  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  43.32 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  44.13 
 
 
295 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  57.47 
 
 
196 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  40.54 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  54.34 
 
 
197 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  69.92 
 
 
123 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  64.23 
 
 
123 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  38.63 
 
 
288 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  37.16 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  60.48 
 
 
124 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  36.02 
 
 
281 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.839406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>