81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1123 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  655    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  99.26 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  99.63 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  96.31 
 
 		 272 aa  522  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  95.94 
 
 		 272 aa  521  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  95.94 
 
 		 272 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  95.57 
 
 		 272 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  95.57 
 
 		 272 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  94.1 
 
 		 272 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  92.25 
 
 		 272 aa  502  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  91.51 
 
 		 272 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  76.67 
 
 		 272 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  74.54 
 
 		 273 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  72.76 
 
 		 273 aa  427  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  75.28 
 
 		 273 aa  420  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  71.64 
 
 		 273 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  71.38 
 
 		 273 aa  394  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  66.92 
 
 		 273 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  63.02 
 
 		 273 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  62.08 
 
 		 273 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  54.48 
 
 		 275 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  55.22 
 
 		 274 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  54.14 
 
 		 273 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  54.31 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  55.22 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  53.73 
 
 		 275 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  53.36 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  53.53 
 
 		 276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  54.48 
 
 		 275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  54.48 
 
 		 275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  54.48 
 
 		 275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  53.16 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  52.59 
 
 		 277 aa  305  6e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  54.31 
 
 		 274 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  53.53 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  53.16 
 
 		 276 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  52.42 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  55.43 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  51.85 
 
 		 277 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  51.48 
 
 		 277 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  55.06 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  52.79 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  51.87 
 
 		 275 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  53.16 
 
 		 275 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  54.31 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  53.93 
 
 		 274 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  54.31 
 
 		 274 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  52.61 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  52.87 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  52.9 
 
 		 278 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  53.36 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  49.82 
 
 		 295 aa  278  8e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  52.09 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  53.16 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  47.29 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  50.95 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  47.78 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  47.04 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  47.74 
 
 		 287 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  46.42 
 
 		 316 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  43.97 
 
 		 266 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  42.09 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  48.52 
 
 		 196 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  47.93 
 
 		 196 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  44.12 
 
 		 197 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  55.37 
 
 		 123 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  52.07 
 
 		 123 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  33.58 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  48.36 
 
 		 124 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  30.45 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  31.3 
 
 		 283 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2132  nitrite extrusion protein 2  93.88 
 
 		 67 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.609003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2196  DNA methylase  93.88 
 
 		 391 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000872225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4645  nitrite extrusion protein 2  91.84 
 
 		 49 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4300  nitrite extrusion protein 2  97.87 
 
 		 50 aa  93.6  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0900  nitrite extrusion protein 2  97.83 
 
 		 49 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0389  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 48 aa  92.8  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1566  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 47 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1951  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 48 aa  92.8  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3273  nitrite extrusion protein 2  100 
 
 		 51 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3994  nitrite extrusion protein 2  97.78 
 
 		 54 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>