68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6482 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  100 
 
 		 196 aa  406  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  86.73 
 
 		 196 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  87.93 
 
 		 277 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  87.36 
 
 		 277 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  83.33 
 
 		 277 aa  314  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  67.35 
 
 		 197 aa  286  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  67.82 
 
 		 276 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  66.67 
 
 		 276 aa  255  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  67.24 
 
 		 276 aa  254  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  67.24 
 
 		 276 aa  254  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  66.09 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  64.94 
 
 		 275 aa  246  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  64.94 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  63.22 
 
 		 275 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  66.67 
 
 		 275 aa  239  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  62.64 
 
 		 275 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  62.64 
 
 		 275 aa  238  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  66.67 
 
 		 275 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  62.07 
 
 		 275 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  62.07 
 
 		 275 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  61.49 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  59.77 
 
 		 274 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  59.77 
 
 		 274 aa  227  7e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  59.54 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  62.64 
 
 		 274 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  62.64 
 
 		 274 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  63.79 
 
 		 275 aa  223  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  62.07 
 
 		 274 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  62.07 
 
 		 274 aa  221  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  62.07 
 
 		 274 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  63.22 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  59.77 
 
 		 275 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  52.87 
 
 		 273 aa  203  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  55.23 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  60.92 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  60.34 
 
 		 275 aa  201  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  59.65 
 
 		 278 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  58.43 
 
 		 278 aa  201  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  51.72 
 
 		 273 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  55.68 
 
 		 287 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  52.05 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  48.28 
 
 		 273 aa  187  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  50.29 
 
 		 273 aa  184  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  53.49 
 
 		 273 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  49.7 
 
 		 273 aa  181  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  47.4 
 
 		 281 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  50.89 
 
 		 273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  46.63 
 
 		 312 aa  171  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  50.3 
 
 		 273 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  46.55 
 
 		 273 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  47.93 
 
 		 315 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  47.93 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  47.93 
 
 		 273 aa  164  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  47.34 
 
 		 272 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  47.34 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  47.93 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  47.34 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  47.34 
 
 		 272 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  47.34 
 
 		 272 aa  161  6e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  43.23 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  44.97 
 
 		 272 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  44 
 
 		 316 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  44.97 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  41.52 
 
 		 266 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  43.09 
 
 		 295 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  35 
 
 		 288 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  35.5 
 
 		 283 aa  89.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  33.73 
 
 		 281 aa  89  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>