71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3741 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  98.19 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  96.74 
 
 
276 aa  556  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  97.1 
 
 
276 aa  558  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  90.58 
 
 
275 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  90.88 
 
 
274 aa  518  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  89.78 
 
 
274 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  87.68 
 
 
275 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  85.92 
 
 
275 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  85.92 
 
 
275 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  85.51 
 
 
274 aa  474  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  85.51 
 
 
274 aa  476  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  85.14 
 
 
274 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  84.06 
 
 
274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  81.52 
 
 
275 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  81.88 
 
 
274 aa  468  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  81.16 
 
 
274 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  84.06 
 
 
274 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  79.71 
 
 
275 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  76.45 
 
 
275 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  78.99 
 
 
275 aa  442  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  76.53 
 
 
275 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  70.76 
 
 
277 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  68.95 
 
 
277 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  65.34 
 
 
277 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  68.84 
 
 
274 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  64.86 
 
 
275 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  61.96 
 
 
273 aa  359  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  64.96 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  64.53 
 
 
275 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  61.92 
 
 
278 aa  342  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  64.91 
 
 
275 aa  340  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  61.31 
 
 
278 aa  337  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  54.71 
 
 
273 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  53.99 
 
 
273 aa  332  6e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  331  7.000000000000001e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  58.15 
 
 
273 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  56.94 
 
 
287 aa  321  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  54.74 
 
 
273 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  55.88 
 
 
273 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  56.23 
 
 
295 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  57.78 
 
 
273 aa  316  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  54.95 
 
 
273 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  53.87 
 
 
273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  53.51 
 
 
273 aa  301  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  53.51 
 
 
273 aa  299  4e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  51.26 
 
 
273 aa  298  4e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  53.53 
 
 
315 aa  298  5e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  53.51 
 
 
272 aa  296  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  53.51 
 
 
272 aa  296  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  53.14 
 
 
272 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  53.51 
 
 
272 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  52.77 
 
 
272 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  53.14 
 
 
272 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  52.4 
 
 
272 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  52.77 
 
 
272 aa  291  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  52.24 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  67.82 
 
 
196 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  50.38 
 
 
316 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  44.09 
 
 
312 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  43.37 
 
 
281 aa  244  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  62.07 
 
 
196 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  45.04 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  54.91 
 
 
197 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  39.46 
 
 
266 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  66.67 
 
 
123 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  62.1 
 
 
124 aa  158  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  62.6 
 
 
123 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  36.82 
 
 
288 aa  149  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  35.38 
 
 
283 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  32.95 
 
 
281 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.839406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>