71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6929 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  67.87 
 
 
277 aa  394  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  66.79 
 
 
277 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  64 
 
 
275 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  64 
 
 
275 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  65.57 
 
 
274 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  65.94 
 
 
276 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  65.22 
 
 
277 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  64.47 
 
 
274 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  63.27 
 
 
275 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  64 
 
 
274 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  64.86 
 
 
276 aa  377  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  63.64 
 
 
275 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  64 
 
 
275 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  63.64 
 
 
275 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  64.86 
 
 
276 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  64.49 
 
 
276 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  63.27 
 
 
274 aa  371  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  64 
 
 
275 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  62.55 
 
 
275 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  64 
 
 
275 aa  362  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  63.87 
 
 
273 aa  362  3e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  63.64 
 
 
274 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  63.27 
 
 
274 aa  359  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  63.27 
 
 
274 aa  357  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  63.64 
 
 
274 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  62.91 
 
 
274 aa  353  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  64 
 
 
274 aa  352  2.9999999999999997e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  66.04 
 
 
275 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  65.54 
 
 
275 aa  344  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  60.44 
 
 
278 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  60.66 
 
 
278 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  58.01 
 
 
295 aa  337  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  59.07 
 
 
287 aa  332  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  62.27 
 
 
274 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  55.47 
 
 
273 aa  325  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  55.11 
 
 
273 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  56.51 
 
 
273 aa  316  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  54.65 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  55.76 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  54.41 
 
 
272 aa  310  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  56.13 
 
 
273 aa  301  9e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  53.82 
 
 
273 aa  296  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  54.41 
 
 
273 aa  295  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  54.81 
 
 
273 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  52.96 
 
 
272 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  51.85 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  52.96 
 
 
272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  51.85 
 
 
273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  51.85 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  51.85 
 
 
272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  51.87 
 
 
315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  51.48 
 
 
272 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  51.48 
 
 
272 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  51.48 
 
 
272 aa  278  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  51.11 
 
 
272 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  45.42 
 
 
287 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  43.68 
 
 
312 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  66.67 
 
 
196 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  44.61 
 
 
316 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  44.4 
 
 
281 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  43.93 
 
 
295 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  63.58 
 
 
196 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  41.92 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  57.8 
 
 
197 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  61.79 
 
 
123 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  62.9 
 
 
124 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  60.16 
 
 
123 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  35.21 
 
 
288 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  33.08 
 
 
283 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  31.84 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.839406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>