71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5400 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5400  protein of unknown function DUF932  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4995  protein of unknown function DUF932  96.73 
 
 		 275 aa  523  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0426401  normal  0.148352 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4210  hypothetical protein  66.3 
 
 		 274 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000000592317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6929  hypothetical protein  65.3 
 
 		 275 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2041  hypothetical protein  63.26 
 
 		 273 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1782  putative F plasmid gene 32-like protein  64.79 
 
 		 277 aa  364  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2944  hypothetical protein  63.81 
 
 		 275 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2571  putative F plasmid gene 32-like protein  63.3 
 
 		 277 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0468  hypothetical protein  63.06 
 
 		 274 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1477  hypothetical protein  64.53 
 
 		 276 aa  358  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3741  hypothetical protein  64.91 
 
 		 276 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2611  protein of unknown function DUF932  62.31 
 
 		 274 aa  356  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.30719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2321  hypothetical protein  63.26 
 
 		 275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.555725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3034  hypothetical protein  60.07 
 
 		 275 aa  354  7.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2734  hypothetical protein  60.07 
 
 		 275 aa  354  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0478  hypothetical protein  61.05 
 
 		 277 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3535  protein of unknown function DUF932  64.15 
 
 		 276 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2618  homologue to gene 32 protein of F plasmid  63.4 
 
 		 276 aa  348  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2835  protein of unknown function DUF932  61.51 
 
 		 275 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.254935  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0664  protein of unknown function DUF932  60.75 
 
 		 275 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.865139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0679  hypothetical protein  60.75 
 
 		 274 aa  341  7e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7557  hypothetical protein  63.57 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0368604 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4156  hypothetical protein  63.4 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418419  normal  0.860751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1973  hypothetical protein  60.38 
 
 		 274 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2321  hypothetical protein  60 
 
 		 275 aa  338  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000877089  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0781  hypothetical protein  60.58 
 
 		 295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001098 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0025  hypothetical protein  60.73 
 
 		 278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000725071  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0030  hypothetical protein  61.19 
 
 		 278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2639  hypothetical protein  61.13 
 
 		 274 aa  331  9e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.562022  normal  0.0586282 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1665  putative F plasmid protein  59.06 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0729576  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1244  hypothetical protein  61.13 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0562318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31200  hypothetical protein  61.13 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120267  unclonable  1.6824e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1869  protein of unknown function DUF932  60.38 
 
 		 274 aa  328  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4158  hypothetical protein  60.38 
 
 		 275 aa  328  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1276  protein of unknown function DUF932  60.75 
 
 		 274 aa  325  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0045  hypothetical protein  54.51 
 
 		 273 aa  318  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1042  protein of unknown function DUF932  56.49 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.995076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3441  hypothetical protein  55.51 
 
 		 272 aa  315  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0034  hypothetical protein  53.38 
 
 		 273 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3134  hypothetical protein  55.56 
 
 		 273 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0931  protein of unknown function DUF932  55.73 
 
 		 273 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4279  hypothetical protein  54.28 
 
 		 273 aa  301  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219978  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3354  protein of unknown function DUF932  56.11 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0754  hypothetical protein  54.51 
 
 		 273 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2883  hypothetical protein  54.2 
 
 		 273 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4682  hypothetical protein  51.33 
 
 		 272 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1400  hypothetical protein  51.71 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.188272 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1123  hypothetical protein  50.38 
 
 		 315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2853  hypothetical protein  50.38 
 
 		 273 aa  272  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0666809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3207  hypothetical protein  49.81 
 
 		 272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4894  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  271  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1064  hypothetical protein  50.95 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274991 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4802  hypothetical protein  49.62 
 
 		 272 aa  270  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3348  hypothetical protein  49.43 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3408  hypothetical protein  50 
 
 		 272 aa  268  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2248  hypothetical protein  49.24 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3899  hypothetical protein  49.11 
 
 		 287 aa  258  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4386  hypothetical protein  49.43 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00134743  normal  0.817249 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3678  hypothetical protein  44.69 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6201  protein of unknown function DUF932  48 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.571939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7306  hypothetical protein  43.43 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0001  hypothetical protein  43.08 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000235069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6482  protein of unknown function DUF932  60.34 
 
 		 196 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0246  protein of unknown function DUF932  55.17 
 
 		 196 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7328  protein of unknown function DUF932  56.65 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.792728  hitchhiker  0.00281621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1214  hypothetical protein  37.05 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.839406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4460  hypothetical protein  38.18 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6477  protein of unknown function DUF932  66.04 
 
 		 123 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7323  protein of unknown function DUF932  67.29 
 
 		 124 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000418502  hitchhiker  0.000715809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4368  hypothetical protein  37.22 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0251  protein of unknown function DUF932  65.09 
 
 		 123 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>